So habe ich mir ein kleines Skript gebaut, welches genau das erleichtert. Es liegt bei mir im Verzeichnis ~/bin/, die Applikationen werden entweder mit dem Paketmanager installiert oder liegen unterhalb des Verzeichnisses ~/Apps/.

Das Standard-Verhalten des Eclipse-Starters wird durch die Umgebungsvariablen

• $ECLIPSE_HOME (zeigt auf das Eclipse-Installationsverzeichnis, Vorgabe ~/Apps/eclipse),
• $JAVA_HOME (zeigt auf das Java JRE-Installationsverzeichnis) und

• $PROJECTS_HOME (zeigt au den Eclipse-Workspace, Vorgabe ~/workspace)

vorgegeben.

Hier die (minimalistische) Hilfeseite:

My universal Eclipse starter v0.2
Supports easy combination of JRE, Eclipse and workspace to
launch an Eclipse session
  -e DIR, --eclipse=DIR    The eclipse installation directory
                           (defaults to the contents of $ECLIPSE_HOME)
  -j DIR, --jre=DIR        The JDK installation directory
                           (defaults to the contents of $JAVA_HOME)
  -w DIR, --workspace=DIR  The workspace
                           (defaults to the contents of $PROJECTS_HOME
                           or ~/workspace)
  -v, --verbose            Print settings before launching eclipse
  -h, --help               This help

Und dann einfach Eclipse starten:

$ eclipse   # startet bei mir Eclipse 3.4 mit Java5 im Workspace ~/projekte
$ eclipse -e ~/Apps/eclipse-3.2 -j ~/Apps/j2sdk1.4.2_17 # startet 'ne alte Kombi
$ eclipse -w ~/another-workspace # nimmt E3.4, Java5 und einen anderen Workspace

Fertig.